リストは、システィーナ礼拝堂で聴いた二つの対照的なモテット、グレゴリオ・アレグリの有名な「ミゼレーレ・マイ・デウス」と、モーツァルトのこのジャンルにおける最後の作品である「アヴェ・ヴェルム・コルプス」から、この作品「ア・ラ・シャペル・シクスティーナ」のインスピレーションを得ました。アレグリの作品から、リストは特徴的な和声を取り入れ、それを基にト短調のパッサカリアを創作しました。この変奏曲は劇的なクライマックスへと盛り上がります。そして、モーツァルトのモテットがロ長調の簡素な編曲で登場します。巧みな転調によって変奏曲は短縮された形で再び現れ、その後、リストはモーツァルトの「アヴェ・ヴェルム・コルプス」を再び嬰ヘ長調で演奏します。このセクションは、後にチャイコフスキーが管弦楽組曲「モーツァルティアーナ」で使用した部分です。リストはモーツァルトの音楽を拡張し、ト長調への緩やかな転調を可能にし、低音でアレグリへの遠い暗示で作品を締めくくっています。
